ISSN:
1573-5109
Source:
Springer Online Journal Archives 1860-2000
Topics:
Agriculture, Forestry, Horticulture, Fishery, Domestic Science, Nutrition
Description / Table of Contents:
Summary A computer programm for the desk-top calculator HP 9810A to analyse sedimentation profiles and to calculate the weight average (Mw) and the number-average molecular weight (Mn) of DNA as well as of their breakage parameters (Nw andNn) is presented. The calculations are based on the radioactivity profiles of tritium-labelled DNA sedimented in alkaline sucrose gradients using a liquid scintillation spectrometer. With the aim of the approximation formula fromBurgi undHershey (1963) the exponentK has been estimated from the sedimentation of standard DNA with standard conditions and yields to 0.353. The data are printed out by mean of a computer-controlled typewriter or as a plot by mean of a computer-controlledX- Y plotter. The drawing program is adapted for different modes of standardisation. The most significant capabilities of the program are the estimation of the molecular weight and breakage number of any fraction or region of the sedimentation profile. In addition the graphic plot permits by use of different standardisation the estimation of quantitative changes under the experimental conditions.
Abstract:
Abstract Описывается програм ма эффективной обраб отки опытных данных для ЭВМHP 9810A. Вычисляются характ еристики (Mw, Mn и дополнит ельно Nw, Nn) для седиментации ДНК в (щелочном) градиенте сахарозы. Предпосылкой этому являются, с одно й стороны, профили радиоактивности, пол ученные при помощи сцинтилляцио нного счётчика, с друг ой —нормирование градиента с помощью стандартных ДНК на основе приближ енной формулы бурги и хершей (1963). В качестве по казателя К в программ е взята полученная в нашей нормировке вел ичина 0,353. Вывод данных и резуль татов осуществляетс я на автоматическом печа тающем устройстве. Кроме тог о предусмотрено граф ическое изображение с помощь ю автоматического рис ующего устройства. Гр афическая часть программы позволяет сопостави ть в количественном о тношении варианты опыта с разл ичной нормировкой, что треб уется для эксперимен тов по репарации ДНК.
Notes:
Zusammenfassung Es wird ein EDV-Programm für den HP 9810 A zur rationellen Auswertung des Sedimentationsverhaltens von DNS im alkalischen Saccharosegradienten, insbesondere zur Berechnung wichtiger Kennzahlen für das Molekulargewicht und für die Bruchhäufigkeiten von DNS beschrieben. Voraussetzung dafür sind Radioaktivitätsprofile und Eichung des Gradienten mit Hilfe von Standard-DNS ausgehend von der Approximationsformel vonBurgi undHershey (1963). Im Programm hat der ExponentK den in unseren Eichläufen ermittelten Wert 0,353. Die Ausgabe der Daten und der Ergebnisse erfolgt als Ausdruck über eine rechnergesteuerte Schreibmaschine. Außerdem ist die graphische Wiedergabe über den rechnergesteuertenx- y-Schreiber vorgesehen. Der graphische Teil des Programms erlaubt es, die Versuchsvarianten (Gradienten) in quantitativer Relation mit unterschiedlicher Normierung auszuwerten, wie es speziell in Experimenten zur DNS-Reparatur notwendig ist.
Type of Medium:
Electronic Resource
URL:
http://dx.doi.org/10.1007/BF02014812
Permalink