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    Evidence for hepatitis E virus quasispecies
    Microbiology Society ; 2004
    In:  Journal of General Virology Vol. 85, No. 11 ( 2004-11-01), p. 3189-3194
    Details
    In: Journal of General Virology, Microbiology Society, Vol. 85, No. 11 ( 2004-11-01), p. 3189-3194
    Abstract: The genetic diversity of hepatitis E virus (HEV) has been extensively analysed during the last decade. Most sporadic and epidemic HEV strains are distributed into genotypes or groups. Nevertheless, few studies have looked at the polymorphism of HEV strains isolated from a given outbreak. A serum bank collected in Tanefdour, Algeria, during an acute hepatitis epidemic (1986–1987), retrospectively confirmed as hepatitis E, was analysed. Of the 69 serum samples collected within an 8-week period, 23 were positive for both partial ORF1 (replicase gene) and ORF2 (capsid gene) sequences. Inter- and intra-patient diversities were assessed by RFLP, and by sequencing a 448 bp sequence corresponding to ORF2. RFLP analysis distinguished three profiles: A (18/23), B (3/23) and C (2/23). Most isolates (18/23) shared 99·7–100 % sequence identity and the remainder showed 1–1·3 % divergence. HEV intra-patient diversity was studied using 12 isolates (seven displaying the major RFLP profile and five displaying minor RFLP profiles). For 9 of 12 isolates, additional intra-patient heterogeneity was revealed by RFLP analysis of 100 clones from each isolate and sequence diversity ranging from 0·11 to 3·4 %. These data strongly support the quasispecies organization of HEV during epidemics and could explain the adaptable behaviour of the virus in the host–pathogen interrelations.
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 0022-1317 , 1465-2099
    URL: Article
    DOI: 10.1099/vir.0.80248-0
    RVK:
    XA 53770
    RVK:
    WA 15000
    Language: English
    Publisher: Microbiology Society
    Publication Date: 2004
    detail.hit.zdb_id: 2007065-2
    SSG: 12
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  • 2
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    Improving the SIR Model: Isolation and Containment Strategies for COVID-19 - A Case Study of Ain-Touta City
    International Information and Engineering Technology Association ; 2023
    In:  International Journal of Safety and Security Engineering Vol. 13, No. 4 ( 2023-09-28), p. 745-752
    Details
    In: International Journal of Safety and Security Engineering, International Information and Engineering Technology Association, Vol. 13, No. 4 ( 2023-09-28), p. 745-752
    Abstract: In the endeavor to halt the transmission of infectious diseases, containment and isolation emerge as pivotal preventive strategies. The elucidation of disease spread dynamics, through the lens of mathematical models, is instrumental in forecasting epidemiological trajectories. This study presents an augmented Susceptible-Infected-Recovered (SIR) model, assimilating these preventive measures, to scrutinize the propagation of COVID-19 since its initial emergence. The combat against this pandemic has predominantly hinged upon non-pharmaceutical interventions (NPIs) including, but not limited to, mask utilization, physical distancing, patient isolation, contact quarantine, and hand hygiene. The focal point of our investigation lies in the examination of the influence of susceptible population containment and infected individual isolation on the evolution of the ongoing outbreak. The basic reproductive number, an indicator of contagiousness, is analyzed over the course of the outbreak, yielding promising outcomes.
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 2041-9031
    URL: Issue
    URL: Journal
    URL: Article
    DOI: 10.18280/ijsse.1304
    DOI: 10.18280/ijsse
    DOI: 10.18280/ijsse.130418
    Language: Unknown
    Publisher: International Information and Engineering Technology Association
    Publication Date: 2023
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  • 3
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    Human rickettsioses in the Batna area, eastern Algeria
    Elsevier BV ; 2012
    In:  Ticks and Tick-borne Diseases Vol. 3, No. 5-6 ( 2012-12), p. 364-366
    Details
    In: Ticks and Tick-borne Diseases, Elsevier BV, Vol. 3, No. 5-6 ( 2012-12), p. 364-366
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 1877-959X
    URL: Article
    DOI: 10.1016/j.ttbdis.2012.10.017
    Language: English
    Publisher: Elsevier BV
    Publication Date: 2012
    detail.hit.zdb_id: 2541872-5
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  • 4
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    Hepatocellular carcinoma: epidemiological profile, clinical and diagnostic aspects and therapeutic modalities. Experience of Batna’s Radiotherapy Center
    Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC) ; 2018
    In:  Batna Journal of Medical Sciences (BJMS) Vol. 5, No. 1 ( 2018-12-25), p. 74-77
    Details
    In: Batna Journal of Medical Sciences (BJMS), Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC), Vol. 5, No. 1 ( 2018-12-25), p. 74-77
    Abstract: Introduction : L’hépatocarcinome est une maladie tumorale grave et lourde, se greffant très souvent sur une cirrhose hépatique. L’amélioration de son pronostic exige d’abords la collecte d’un maximum d’informations à tous les stades de son évolution. Patients et méthodes : 63 cas d’hépato carcinome (CHC), ont été enregistrés entre juillet 2014 et février 2017. Une étude descriptive a été réalisée pour déterminer les caractéristiques de cette maladie dans notre région. Résultats : Tous les cas se sont développés sur un foie cirrhotique, d’origine virale. La tranche d’âge 60-70 ans est la plus touchée avec 23patients. La sex-ratio était de 1,17 en faveur des hommes. Deux régions se distinguent avec respectivement 24 et 14 % des cas. 81 % des patients étaient des stades localisés, 47 patients avaient des comorbidités, 38 avaient des stades Child A. Le diagnostic reposait sur les critères BCLC, 29 Patients étaient PS «0 », 21 PS «1». Le volume moyen était de 57,3 mm (28 mm -137 mm). Les segments IV et V occupent la première place avec 7 nodules chacun. 37 patients replissant les critères requis pour la greffe hépatique étaient en attente, 27 parmi eux ont reçu une radiothérapie 3D focalisée. Les résultats sont très encourageants en matière de tolérance, de contrôle local et de survie avec en plus un impact positif sur la prolongation de la durée d’éligibilité pour la greffe hépatique. Conclusion : Une meilleure connaissance des aspects épidémiologiques et cliniques des CHC associée à une prise en charge précoce en passant par le dépistage va indiscutablement améliorer le pronostic jusque-là médiocre de ces tumeurs.
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 2437-0665
    Uniform Title: Carcinome hépatocellulaire : profil épidémiologique, aspects cliniques, diagnostiques et modalités thérapeutiques. Expérience du centre de radiothérapie de Batna
    URL: Issue
    URL: Journal
    URL: Article
    DOI: 10.48087/BJMSfi.2018.5100
    DOI: 10.48087/BJMS
    DOI: 10.48087/BJMSoa.2018.5117
    Language: Unknown
    Publisher: Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC)
    Publication Date: 2018
    detail.hit.zdb_id: 3108150-2
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  • 5
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    Prevalence of hepatitis C virus infection in the general population of the city of Barika
    Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC) ; 2020
    In:  Batna Journal of Medical Sciences (BJMS) Vol. 7, No. 1 ( 2020-5-2), p. 27-30
    Details
    In: Batna Journal of Medical Sciences (BJMS), Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC), Vol. 7, No. 1 ( 2020-5-2), p. 27-30
    Abstract: Introduction. L’hépatite virale C pose un réel problème de santé publique à l’échelle mondiale. En Algérie, sa prévalence est modérée, mais il existe une variabilité géographique dans sa distribution, la willaya de Batna est endémique pour la pathologie. Le dépistage précoce de cette pathologie permet de réduire la morbidité et la mortalité liées à la cirrhose et au carcinome hépatocellulaire. Notre objectif est de déterminer la prévalence de l’hépatite C dans la ville de Barika par la réalisation d’un dépistage dans la population générale. Matériels et Méthodes. Une étude descriptive transversale de prévalence de l’hépatite virale C dans la ville de Barika à la wilaya de Batna par la réalisation d’une campagne de dépistage de l’hépatite C dans la population générale. Ce dépistage a été organisé pendant 10 jours en mois de mars 2015. Les personnes qui ont été concernées par ce dépistage sont les patients et leurs accompagnateurs qui transitent par les consultations de la polyclinique centrale de Barika pour d’autres pathologies que l’hépatite virale C. Le dépistage a été réalisé par un test rapide immuno-chromatographique sur bandelette (les tests rapides d’orientation diagnostique (TROD)). Un test ELISA de confirmation a été réalisé sur les prélèvements positifs. Résultats. 413 personnes ont été dépistées (114 hommes et 299 femmes), Le test rapide d’orientation diagnostique était positif chez 27 patients, soit une prévalence de 6,5 %. La plupart des patients séropositifs sont des femmes (77,8%). Cette prévalence est plus élevée chez les femmes (7,02%) que chez les hommes (5,26%). La tranche d’âge 60-69 ans est la plus touchée 40,70 %, la séroprévalence dans cette classe d’âge est de 12,79%. Toutes les personnes dépistées séropositives au VHC ont eu un prélèvement sanguin à la recherche de l’ARN VHC par PCR, La PCR VHC est revenue indétectable chez deux patients. Conclusion. Notre campagne de dépistage anonyme et gratuit de l’hépatite virale C a objectivé une estimation de prévalence de l’infection par le VHC dans la ville de Barika à 6,5%, ce qui a situé notre région dans une zone de forte endémicité de l’infection par le VHC
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 2437-0665
    Uniform Title: Prévalence de l’infection par le virus de l’hépatite C dans la population générale de la ville de Barika
    URL: Journal
    URL: Article
    DOI: 10.48087/BJMS
    DOI: 10.48087/BJMSoa.2020.7107
    Language: Unknown
    Publisher: Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC)
    Publication Date: 2020
    detail.hit.zdb_id: 3108150-2
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  • 6
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    Rickettsia aeschlimannii Infection, Algeria
    Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ; 2008
    In:  Emerging Infectious Diseases Vol. 14, No. 11 ( 2008-11), p. 1814-1815
    Details
    In: Emerging Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Vol. 14, No. 11 ( 2008-11), p. 1814-1815
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 1080-6040 , 1080-6059
    URL: Article
    DOI: 10.3201/eid1411.071221
    Language: English
    Publisher: Centers for Disease Control and Prevention (CDC)
    Publication Date: 2008
    detail.hit.zdb_id: 2004375-2
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  • 7
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    Interest of the quantification of HBsAg in the chronic carrier of the hepatitis B virus
    Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC) ; 2020
    In:  Batna Journal of Medical Sciences (BJMS) Vol. 7, No. 2 ( 2020-11-09), p. 137-141
    Details
    In: Batna Journal of Medical Sciences (BJMS), Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC), Vol. 7, No. 2 ( 2020-11-09), p. 137-141
    Abstract: La quantification de l’AgHBs a montré un intérêt dans la classification du patient dans les différentes phases de l’infection chronique B. Pour évaluer l’impact de celle-ci, nous avons mené une étude prospective chez les porteurs chroniques du VHB, sur une période de 5 ans. Nous avons colligé 210 patients (114 hommes ; 96 femmes), avec un âge moyen de 43 ans (18 – 80 ans), une cytolyse dans 12% des cas (25/210) et 90% des patients AgHBe négatif (189/210). L’ADN-VHB moyen est de 3,25 ± 2 Log UI/ml. Une fibrose modérée à sévère (F2, F3, F4) est noté dans 21,42% (45/210). Le taux moyen de l’AgHBs est de 2,84 ± 1,1 Log UI/ml, il est de 4,36 LogUI/ml chez le sujet jeune versus 3 LogUI/ml pour le sujet âgé. Nous avons noté une corrélation entre le taux de l’AgHBs et celui de l’ADN VHB (r=0,40, p 〈 0,001). Ce taux est plus élevé pour l’AgHBe positif (3,81 LogUI/ml vs 2,77 LogUI/ml). Les taux moyens d’AgHBs sont de 4,33 ; 3,13 ; 2,87 et 3,19 logUI/ml aux phases 1, 2, 3 et 4 respectivement. Entre phase 1 et phase 3, il est de 3,6 ± 1,5 vs 2,07 ± 1 (p 〈 0,001). Entre phase active (2 et 4) et phase inactive (3), il est de 3,35 ± 0,7 vs 2,07 ± 1 (p 〈 0,00001). Pour un taux d’ADN VHB 〈 2000 UI/ml et d’AgHBs 〈 1000 UI/ml, la proportion de porteurs inactifs est de 43% (90/210) contre 59% (124/210) par la définition usuelle (ADN VHB ( 〈 2000 UI/ml).
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 2437-0665
    Uniform Title: Intérêt de la quantification de l’AgHBs chez le porteur chronique du virus de l’hépatite B
    URL: Journal
    URL: Article
    DOI: 10.48087/BJMS
    DOI: 10.48087/BJMSoa.2020.7216
    Language: Unknown
    Publisher: Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC)
    Publication Date: 2020
    detail.hit.zdb_id: 3108150-2
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  • 8
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    Evaluation of the performance and concordance of Fibroscan and the APRI score in patients with chronic hepatitis C
    Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC) ; 2020
    In:  Batna Journal of Medical Sciences (BJMS) Vol. 7, No. 1 ( 2020-5-2), p. 19-23
    Details
    In: Batna Journal of Medical Sciences (BJMS), Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC), Vol. 7, No. 1 ( 2020-5-2), p. 19-23
    Abstract: Introduction. Plusieurs méthodes non invasives d’évaluation de la fibrose ont été développées qui ont prouvé leur intérêt en cas d’hépatite virale chronique C. L’objectif de cette étude est d’évaluer la performance diagnostique de la fibrose par le Fibroscan et le score APRI en les comparant à la biopsie hépatique chez les patients atteints d’hépatite virale chronique C dans la wilaya de Batna. Matériels et Méthodes. Une étude descriptive d’observation de 72 patients atteints d’hépatite C chronique, confirmés par une PCR, ont bénéficié d’une évaluation de la fibrose hépatique par le Fibroscan, le score APRI et la biopsie hépatique. Les valeurs de coefficient Kappa ont été utilisées pour évaluer le degré d’accord entre ces examens. La performance diagnostique de Fibroscan a été évaluée par la mesure des aires sous la courbe ROC (AUROC) et la valeur seuil optimale. Résultats. L’âge moyen de ces patients est de 56,35 ± 8,63 ans. Un sex-ratio (H/F) de 0,47. La moyenne de l’élasticité de ces patients est de 16,08 ± 9,99 Kpa, allant de 4,30 Kpa à 46,40 Kpa. Les résultats de l’analyse de la concordance ont montré un accord modéré significatif entre le Fibroscan et la PBH avec un Kappa à 0,597, P 〈 0,001. Les AUROC pour le Fibroscan/ le score APRI pour le diagnostic de fibrose significative (F ≥ 2), sévère (F ≥ 3) et de cirrhose (F = 4) sont 0,924 (0,863 - 0,986) / 0,710 (0,578- 0,842) ; 0,923 (0,848-0,999) / 0,804 (0,702- 0,906) ; 0,924 (0,855 - 0,992) / 0,878 (0,800 - 0,956) respectivement. Les seuils optimaux de l’élasticité pour la fibrose significative (F ≥ 2), sévère (F ≥ 3) et de cirrhose (F = 4) sont 9,9 Kpa, 11,6 Kpa, 15,3 Kpa respectivement. Conclusion. Dans notre série, le Fibroscan reste l’examen le plus performant dans le diagnostic de la fibrose hépatique quel que soit son degré.
    Type of Medium: Online Resource
    ISSN: 2437-0665
    Uniform Title: Évaluation de la performance et de la concordance du Fibroscan et du score APRI chez les patients atteints d’hépatite chronique C
    URL: Journal
    URL: Article
    DOI: 10.48087/BJMS
    DOI: 10.48087/BJMSoa.2020.7105
    Language: Unknown
    Publisher: Association pour la Recherche Pharmaceutique et l Enrichissement des Connaissances (ARPEC)
    Publication Date: 2020
    detail.hit.zdb_id: 3108150-2
    Location Call Number Limitation Availability
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