In:
Methods in Ecology and Evolution, Wiley, Vol. 11, No. 10 ( 2020-10), p. 1199-1206
Abstract:
Los estudios de biodiversidad dependen en gran medida de las estimaciones de las distribuciones de especies obtenidas a menudo a través de modelos de nicho ecológico. Existen numerosos paquetes de software diseñados para modelar nichos ecológicos y proyectar proyectar áreas de distribución potenciales utilizando técnicas de aprendizaje automático y métodos estadísticos. Sin embargo, ningún paquete cuenta con una interfaz gráfica que permite a los usuarios realizar calibraciones y selección de modelos (i.e. buscar el modelo con el mejor rendimiento) de modelos basadas en formas convexas como los elipsoides, estos pueden coincidir mejor con las formas del nicho ecológico fundamental, incorporando herramientas para explorar, modelar y evaluar nichos y distribuciones que son intuitivas tanto para principiantes como para usuarios expertos. Aquí describimos un paquete de r , N iche T ool B ox ( ntbox ), que permite a los usuarios realizar todos los pasos de procesamiento involucrados en el modelado de nicho ecológico: descargar y curar datos de presencia, obtener y transformar capas de datos ambientales, seleccionar variables ambientales, explorar relaciones entre los espacios geográfico y ecológico, calibrar y seleccionar modelos de elipsoides, evaluar modelos utilizando pruebas ROC binomiales y parciales, evaluar el riesgo de extrapolación y realizar operaciones de sistemas de información geográfica a través de una interfaz gráfica. Además, se puede generar un resumen de todo el flujo de trabajo para su uso como algoritmo independiente o como parte de informes de investigación. El método se explica en detalle y se prueba mediante el modelado de la especie de felino amenazada Leopardus wiedii . Los datos de presencia georreferenciados para esta especie se muestran de manera puntual y con el polígono de la UICN. Esta información se utiliza para ilustrar las herramientas disponibles para acceder, procesar y explorar datos de biodiversidad (e.g. número de puntos y cronología de recolección) y la transformación de datos ambientales (e.g. un PCA resumido para 19 capas bioclimáticas). También se muestran visualizaciones de nichos ecológicos tridimensionales modelados como elipsoides de volumen mínimo y sus estadísticas. Finalmente, el modelo de nicho se proyecta al espacio geográfico, para representar un mapa de idoneidad potencial correspondiente. El uso de ntbox permite un medio rápido y directo para recuperar y manipular datos de localidades de presencia y ambientales, que luego se pueden utilizar en la calibración, proyección y evaluación del modelo para estimar las distribuciones de especies en el espacio geográfico y sus correspondientes combinaciones ambientales.
Type of Medium:
Online Resource
ISSN:
2041-210X
,
2041-210X
DOI:
10.1111/2041-210X.13452
Language:
English
Publisher:
Wiley
Publication Date:
2020
detail.hit.zdb_id:
2528492-7
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