In:
Methods in Ecology and Evolution, Wiley, Vol. 14, No. 9 ( 2023-09), p. 2205-2215
Abstract:
El lenguaje de programación de código abierto ‘R’ se ha convertido en una herramienta común entre paleobiólogos. Su popularidad dentro de esta comunidad continúa creciendo, con cada vez más artículos que citan el uso de R y sus paquetes. Sin embargo, todavía faltan protocolos para la preparación de los datos, así como marcos de actuación para la aplicación de dichos protocolos. Por ello, los flujos de trabajo para la preparación de datos suelen resultar confusos y a menudo no reproducibles, incluso cuando se facilita el código. Además, debido a la falta de accesibilidad y documentación del código, los paleobiólogos se ven obligados frecuentemente a ‘reinventar la rueda’ para encontrar soluciones a problemas ya resueltos por otros miembros de la comunidad. Por este motivo presentamos palaeoverse , un paquete colaborativo de R para facilitar la preparación y exploración de datos en paleobiología cuantitativa. El paquete es de acceso libre y posee tres principios básicos: (1) agilizar la preparación y análisis de datos; (2) facilitar la lectura del código y (3) mejorar la reproducibilidad de los resultados. Para alcanzar estos objetivos, evaluamos las necesidades analíticas de la comunidad paleobiológica a través de una encuesta en línea, además de incorporar nuestras propias experiencias. En primer lugar, en el presente trabajo mostramos los resultados de la encuesta que determinaron el desarrollo de este paquete. A continuación, describimos y demostramos la funcionalidad disponible en palaeoverse, además de proporcionar ejemplos de utilización. Finalmente, discutimos los recursos disponibles para la comunidad y los planes futuros del proyecto palaeoverse. palaeoverse es un paquete colaborativo de R en paleobiología, desarrollado con la intención de unir a paleobiólogos y establecer normas consensuadas para una investigación cuantitativa de alta calidad. Este paquete proporciona una plataforma de fácil utilización para la preparación de datos para su análisis, con un código abierto bien documentado para aumentar la transparencia. La funcionalidad de palaeoverse mejora la reproducibilidad y accesibilidad del código, lo que es beneficioso tanto para el proceso de revisión como para futuras investigaciones.
Type of Medium:
Online Resource
ISSN:
2041-210X
,
2041-210X
DOI:
10.1111/2041-210X.14099
Language:
English
Publisher:
Wiley
Publication Date:
2023
detail.hit.zdb_id:
2528492-7
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