In:
EPPO Bulletin, Wiley, Vol. 52, No. 2 ( 2022-08), p. 394-418
Abstract:
Высокопроизводительное секвенирование (HTS) ‐ это мощный инструмент, позволяющий одновременно обнаруживать и потенциально идентифицировать любые организмы, присутствующие в образце. Растущий интерес к применению технологий HTS для рутинной диагностики в лабораториях, занимающихся здоровьем растений, требует разработку рекомендаций по подготовке лабораторий к проведению HTS‐тестирования. В данном документе описаны общие и технические рекомендации, которые помогут лабораториям пройти сложный процесс подготовки лаборатории к проведению HTS‐тестов в рамках существующих систем обеспечения качества. Рассматриваются все этапы для обеспечения надежных и воспроизводимых результатов, начиная с выделения нуклеиновых кислот и заканчивая анализом и интерпретацией данных. Настоящее руководство актуально для обнаружения и идентификации любого вредного организма растений (например, членистоногих, бактерий, грибов, нематод, инвазивных растений или сорняков, простейших, вироидов, вирусов) и из любого типа матрицы (например, чистая культура микроорганизмов, ткани растений, почва, вода), независимо от технологии ВПC (например, ампликонное секвенирование, дробовое секвенирование) и области применения (например, программа надзора, фитосанитарная сертификация, карантин, контроль импорта). Настоящее руководство составлено в общих терминах, чтобы облегчить внедрение технологий HTS в рутинную диагностику вредителей растений и обеспечить её более широкое применение во всех областях защиты растений, включая научные исследования. В дополнительных материалах приводится глоссарий соответствующих терминов.
Type of Medium:
Online Resource
ISSN:
0250-8052
,
1365-2338
Language:
English
Publisher:
Wiley
Publication Date:
2022
detail.hit.zdb_id:
2033181-2
SSG:
12
Permalink
