In:
Methods in Ecology and Evolution, Wiley, Vol. 10, No. 8 ( 2019-08), p. 1157-1170
Abstract:
Les facteurs de stress anthropiques ont de fortes répercussions sur les écosystèmes. Pour comprendre leur influence, une connaissance détaillée des relations trophiques entre les espèces est essentielle. Cependant, cela nécessite un échantillonnage à haute résolution au sein des communautés, en particulier pour des écosystèmes tropicaux très diversifiés. Nous avons utilisé le metabarcoding des contenus intestinaux sur une large gamme de poissons de récifs coralliens (8 familles, 22 espèces) à Moorea, en Polynésie française, pour vérifier si cette technique permettait d'obtenir la structure d'un réseau trophique marin hyper‐diversifié. De plus, nous avons cherché à savoir si les groupes taxonomiques (familles) et les affectations trophiques traditionnelles à grande échelle expliquaient le régime alimentaire du poisson selon quatre paramètres différents permettant de quantifier les interactions prédateur‐proie. Le metabarcoding a produit un grand nombre (4 341) d'unités taxonomiques opérationnelles uniques (i.e. des proies) assorties d'affectations taxonomiques à haute résolution (i.e. souvent au niveau du genre ou de l'espèce). Nous démontrons que, sur plusieurs métriques, le groupe taxonomique au niveau de la famille est un prédicteur de relations trophiques empiriques toujours meilleur, bien que faible, par rapport aux affectations fonctionnelles à grande échelle fréquemment utilisées. Notre méthode révèle également un réseau trophique complexe avec une répartition à échelle précise entre les espèces, soulignant davantage l'importance d'examiner les régimes alimentaires des poissons au‐delà des grandes catégories trophiques. Nous démontrons la capacité du metabarcoding à reconstruire des réseaux alimentaires diversifiés et complexes avec une résolution exceptionnelle, une avancée significative par rapport à la reconstruction traditionnelle du réseau alimentaire. De plus, cette méthode nous permet d'identifier la niche trophique des espèces avec une modélisation basée sur des niches, même à travers des assemblages d'espèces hyper‐diversifiés tels que les récifs coralliens. Concomitamment à des techniques complémentaires telles que l'analyse des isotopes stables, l'application du metabarcoding à des communautés entières fournira des informations sans précédent sur les flux d'énergie et de nutriments et nous renseignera sur leur vulnérabilité aux perturbations, même dans les écosystèmes les plus diversifiés du monde.
Type of Medium:
Online Resource
ISSN:
2041-210X
,
2041-210X
DOI:
10.1111/2041-210X.13206
Language:
English
Publisher:
Wiley
Publication Date:
2019
detail.hit.zdb_id:
2528492-7
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