ISSN:
0025-116X
Keywords:
Chemistry
;
Polymer and Materials Science
Source:
Wiley InterScience Backfile Collection 1832-2000
Topics:
Chemistry and Pharmacology
,
Physics
Description / Table of Contents:
The paper describes a new method for the preparation of oligonucleotide fragments, which can be used as building blocks for polynucleotide synthesis. It essentially uses nucleic acid constituents of the general formula X—A, pB and pC—Y in a chemical cooligocondensation, A, B and C being nucleosides, X and Y blocking groups which confer to the protected oligonucleotide chain a certain affinity (“affinity blocking groups”). Examples of cooligocondensation reactions are given, in which a uridine unit is the 3′-terminal affinity blocking group. Thus, thymidylic acid is reacted with derivatives of ribouridylic acid, the two types of products (pdT), and (pdT),-rU are separated by chromatography on boronate columns and the individual chains are obtained pure by DEAE-cellulose or paper chromatography. Analogously, the cooligocondensation of thymidylic acid with O2′, O3′-(diacetylribouridyl-5′,3′-yl)-N-(acetyl)deoxycytidine-5′-phosphate gave sequences (pdT)n—dC—rU. Using 5′-O-[p-anisyldimethyl]thymidine, thymidylic acid and O2′,O3′-diacetylribouridylic acid, the cooligocondensation of a three component-system was studied. Differences to the conventional stepwise synthesis and advantages of the cooligocondensation method are discussed.
Notes:
Es wird ein neues Verfahren zur Gewinnung von Oligonucleotid-Fragmenten beschrieben, die zum Aufbau von Polynucleotiden eingesetzt werden können.Es beruht auf der chemischen Cooligokondensation von Nucleinsäurebausteinen der allgemeinen Formel X—A, pB und pC—Y. Dabei sind A, B und C beliebige Nucleoside. X und Y sind Schutzgruppen, die der geschützten Oligonucleotidkette eine bestimmte Affinität verleihen (sog. „Affinitäts-Schutzgruppen“). Es werden Beispiele besprochen, bei denen eine 3′-terminale Uridineinheit als Affinitätsschutzgruppe dient. So wurde Thymidylsäure mit Derivaten der Ribouridylsäure cooligokondensiert, die beiden Typen von Produkten - (pdT)n und (pdT)n—rU - durch Chromatografie auf Boratsäulen getrennt und anschließend die einzelnen Sequenzen durch DEAE-Cellulose oder Papierchromatographie in reiner Form gewonnen. Die Cooligokondensation von Thymidylsäure mit O2′+ O3′-(Diacetylribouridyl-5′,3′-yl)-N-(acetyl)desoxycytidin-5′-phosphat ergab Sequenzen (pdT)n—dC—rU. Weiterhin wurde die Dreikomponenten-Cooligokondensation von 5′-O-[p-Anisyldiphenylmethyl]thymidin mit Thymidylsaure und O2′,O3′-Diacetylribouridylsäure untersucht. Unterschiede und Vorteile des Cooligokondensations-Verfahrens gegeniiber der bisher üblichen schrittweisen Methode werden diskutiert.
Additional Material:
5 Ill.
Type of Medium:
Electronic Resource
URL:
http://dx.doi.org/10.1002/macp.1975.021761013
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